營利事業若因原料損壞而無法加工製造，或如食品加工廠食品原料過期等等報廢原物料，報廢程序，應依營利事業所得稅查核準則第101條之1規定辦理。若未報請主管稽徵機關核備，其營利事業所得稅結算申報列報其他損失（原料報廢損失）將因未提供原料毀棄事實之相關證明文件，予以剔除其他損失核定補稅，不得不慎。
正確程序除可依會計師查核簽證報告或年度所得稅查核簽證報告，並檢附相關資料核實認定其報廢損失者外，應於於事實發生後30日內檢具清單，如商品變質報廢或災害申請書、損失清單及說明書，報經該管稽徵機關派員勘查監毀，並取具證明文件。